据悉，T2设置了120台自助值机、52台自助行李托运设备，旅客可通过自助设备办理选择座位、打印登机牌、行李托运手续（仅限常规尺寸行李）等服务。自助值机设备分布在各值机区，旅客如果携带了需托运的行李，可前往值机区H、L，使用自助行李托运设备办理托运手续；如果行李超重的话，国内航班旅客可在H区的设备上通过微信、支付宝等方式实现逾重行李费自助付费（仅限南航实际承运航班）。
而乘坐南航国内出港航班无行李托运的旅客，在线上值机后可在手机上生成二维码电子登机牌，即可凭二维码直接前往安检。与之前不同的是，旅客在安检后手机上的二维码电子登机牌会被加注“安检验讫章”，随后凭带有安检验讫章的电子登机牌即可登机，不需要纸质登机牌或是在安检打印纸质凭证。登机口支持为有需要的旅客打印登机凭条。
除智能化乘机服务外，南航还将提供网上查询航班动态、预订餐食、改签、获取航延证明、开具机票电子发票等服务。
截至目前，南航已在广州、北京、深圳、上海等26个国内机场及2个境外机场开通了电子登机牌服务，后续将进一步加大推广力度，使电子登机牌服务覆盖更多的境内外机场，同时在更多机场启用电子“安检验讫章”。
如果需要到人工柜台办理乘机手续，南航国内航班旅客可到E区、F区、G区办理，国际（地区）航班旅客可到P区办理。南航头等舱、公务舱旅客及南航金银卡或天合优享会员，乘坐国内航班可到C区、D区相应柜台办理，乘坐国际（地区）航班可到Q区相应柜台办理。
南航代理的大韩航空、越南航空、法国航空、俄罗斯航空、中华航空等天合联盟航空公司，以及泰国国际航空、新加坡航空、日本航空公司也将于5月19日转场至广州白云机场T2运行。乘坐上述航空公司航班的旅客，在M、N区办理乘机手续。
