台“交通部”2016年12月1日正式收回复兴航空航权，台“民航局”表示，航权分配作业预计会在本月底完成，预计下周就会召开说明会，让有意愿经营的业者提出申请。
台“民航局”企划组组长陈昭谕说，兴航收回的航权数量蛮多，因此会先开说明会，向业者说明以后，请业者提出营运需求，若需求没有超过容量班次限制，就会照业者需求分配，如果超过的话会召开航权分配会议进行分配，把整个分配建议报给台“交通部”，等台“交通部”核可后，就会通知业者，预估整个作业会在12月底完成。航权分配完成后，就会进行航权抽办包括申请时间带、航线证书、报班表票价，得跟双方民航主管机关分别进行作业。
目前复兴航空两岸航线共26条航线、每周共61班，其中最抢手的黄金航线包括松山─上海浦东每周有3班，10月搭载率约7成4，台中─上海浦东航线也是每周3班，搭载率约7成，松山─虹桥航线10月搭载率也有7成9;此外，松山─福州及松山─杭州也经营得不错，上个月载客率分别为68%及82%.
