今年春运期间，南航计划执行航班51806班，加班包机5602班，总计将执行57408班，航班量比2008年春运同比增加15.5%。据预测，南航在今年春运期间将承运旅客588万人次，平均每日承运14.7万人，高峰期内每日承运人数将突破18万。
为应对春运期间客流量增长的需求，南航共将安排国内加班包机5333班，国际加班包机139班，调机130班，其中国内加班包机主要增加了由广州往返海口、武汉、长沙、重庆、成都等地的航班；深圳往返武汉、长沙、海口等地的航班；郑州往返厦门、温州、杭州、南京、广州、三亚、海口航线、昆明、成都、重庆航线；武汉往返广州、深圳、珠海、上海、恩施、宜昌、福州、厦门、海口、三亚、昆明、成都的航班。
为做好2009年春运工作，南航成立了由公司主要领导为组长的春运保障工作领导小组，召开春运工作动员大会，要求以最好的精神状态、最高的工作标准投入到春运保障工作中，积极履行社会责任，确保春运期间旅客安全、有序、顺利、满意出行。
春运期间，南航将实行各级领导值班制度和生产单位24小时值班制度；合理安排运力投放计划，科学调配运力，做好运力备份，保证有充足的适航运力；精心安排精英飞行和乘务人员执行春运航班飞行任务；地面服务增加特殊服务人员，确保对无人陪伴儿童、老人或残疾旅客等提供优质细节服务，同时增设团体柜台；南航将为不同离港地点的航班配备不同风味的食谱；提前做好航班不正常情况下的紧急处理预案，在各主要机场分别增加数千个宾馆床位，并且每天保持上千份食品饮料库存，保证能安排所有滞留旅客食宿。为方便春运期间旅客查询航班、购买机票、业务咨询等需求，南航完善95539短信平台服务功能。在因天气等原因发生航班延误时，通过95539短信平台及时向旅客通报延误信息，旅客也可通过电话或网络等多种途径查询航班延误信息。
